Que la prueba PCR no puede identificar

CIUDAD DE MEXICO, 9 de diciembre.- Los científicos identificaron una versión “sigilosa” de la variante Omicron que no puede ser detectada con las pruebas de rutina que los funcionarios

de salud pública están utilizando para rastrear su propagación en todo el mundo.
La variante sigilosa tiene muchas mutaciones en común con la variante estándar Omicron, pero le falta un cambio genético específico que permite utilizar las pruebas PCR de laboratorio como instrumento rápido y listo para detectar los posibles casos.
Los investigadores señalan que es demasiado pronto para saber si la nueva forma de la variante Omicron se propagará de la misma manera que la variante estándar, pero que la versión “sigilosa” es genéticamente distinta y, por tanto, es posible que se comporte de forma diferente.
La variante sigilosa se detectó por primera vez entre los genomas del virus de covid-19 enviados en los últimos días desde Sudáfrica, Australia y Canadá, sin embargo, la dificultad para detectar la variante significa que ya pudo haberse propagado más ampliamente. Entre las pocas docenas de casos identificados hasta ahora, ninguno se encuentra en el Reino Unido.
El descubrimiento se produjo en el momento en que el primer ministro dijo al gabinete que la variante Omicron parecía ser más transmisible, y los funcionarios admitieron que esto tendría consecuencias por su impacto, y la probabilidad de que se necesitaran más restricciones.
La Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido informó que el martes se registraron otros 101 casos confirmados de la variante Omicron en el Reino Unido. Esto eleva el número total de casos en el Reino Unido a 437. De los 101 nuevos casos, uno se confirmó en Gales, mientras que en Irlanda del Norte no se han registrado nuevos casos.
En la reunión del gabinete del martes por la mañana, a la que también asistieron el asesor científico principal del Gobierno, Patrick Vallance, y el director médico de Inglaterra, Chris Whitty, Johnson comentó a los ministros que los “primeros indicios” eran que la variante Omicron era más transmisible que la variante dominante existente, Delta, según un comunicado del número 10 de Downing Street.
El vocero de Johnson indicó que la siguiente medida de contingencia seguía siendo la posible imposición del llamado plan B, el cual introduciría un certificado de vacunación e indicaciones para trabajar desde casa en la medida de lo posible.
Aunque el gobierno “querría asegurarse de que el parlamento tiene su opinión” sobre cualquier nueva norma, dijo el vocero, los ministros tienen las facultades existentes para imponer las restricciones del plan B de forma unilateral, por ejemplo, en caso de que fueran necesarias durante el receso navideño de la Cámara de los Comunes.
A pesar de estas consideraciones, el vocero confirmó que, por el momento, el consejo oficial seguía siendo que las personas regresaran a sus centros de trabajo si podían hacerlo, aunque tomando en consideración medidas de mitigación como la ventilación y las pruebas. Dijo:
“Alentamos a las empresas a que reincorporen a su personal a la oficina, en sintonía con las directrices”.
El descubrimiento de la nueva forma de la variante Omicron hizo que los investigadores dividieran el linaje B.1.1.529 en Omicron estándar, conocido como BA.1, y la variante más reciente, conocida como BA.2. El profesor François Balloux, director del Instituto de Genética del University College de Londres, señaló que 42, es decir, aproximadamente el 6% de los 709 genomas de la variante Omicron enviados a la base de datos genómica Gisaid eran BA.2.
“Existen dos linajes dentro de Omicron, BA.1 y BA.2, que se diferencian mucho desde el punto de vista genético”, dijo. “Los dos linajes podrían comportarse de forma diferente”.
Los científicos utilizan el análisis de todo el genoma para confirmar la variante que causa la infección de covid-19, pero las pruebas PCR en ocasiones pueden proporcionar una pista.
Aproximadamente la mitad de las máquinas de PCR en el Reino Unido buscan tres genes en el virus, pero la variante Omicron (y la variante Alfa que la precede) solo son positivas en dos de ellos. Esto se debe a que la variante Omicron, al igual que la Alfa, tiene un cambio genético llamado supresión en el gen “S” o spike. La falla significa que las pruebas PCR que presentan la llamada “falla en el objetivo del gen S” son altamente indicativas de las infecciones causadas por la variante Omicron.

Extraoficialmente, algunos investigadores llaman a la nueva variante “ómicron sigiloso” porque no tiene la supresión que permite que las pruebas PCR la detecten. La preocupación de algunos investigadores es que la variante sigilosa se propague sin ser detectada mientras los funcionarios de salud pública se centran en las pruebas PCR para la variante Omicron estándar.

Una de las principales incógnitas es cómo surgió la nueva variante. Aunque forma parte de la variante Omicron, es tan distinta desde el punto de vista genético que podría ser considerada una nueva “variante preocupante” si se propaga rápidamente. Que dos variantes, la BA.1 y la BA.2, surjan en una sucesión tan rápida con mutaciones compartidas es “preocupante”, según un investigador, y sugiere que a la vigilancia de la salud pública “le falta una gran pieza del rompecabezas”.
En tercer lugar, se analizó las posibilidades de regular el crecimiento celular del material. Se programaron las células para expresar la toxina endoribonucleasa (MazF) que puede detener el crecimiento celular y hasta provocar la muerte de las células. Con ello, se utilizó el hidrogel para imprimir una estructura donde se comprobó que la proliferación de colonias se había reducido, aunque más tarde el crecimiento se restauró en cierto modo.

«Dicho sistema de regulación se puede diseñar adicionalmente para controlar eficazmente el crecimiento celular y / o inducir la muerte celular dependiendo de la necesidad» aseguran en el informe. Esta cualidad plantea la posibilidad de contar con un material que crece en entornos controlados, lo que para los investigadores es potencialmente interesante en aquellos lugares donde escasean los recursos como nuevos planetas.

Viajando a Marte

«Nuestro bioenlace microbiano también podría ser particularmente útil para la construcción de estructuras en el espacio o hábitats extraterrestres» afirman los investigadores. Transportar los recursos necesarios para establecer colonias en el planeta rojo supondría un esfuerzo titánico para las agencias y empresas espaciales.

Por este motivo, se plantea la posibilidad de generar los recursos en el mismo planeta aprovechando los materiales que hay allí o llevando materiales que permitan su cultivo. La tinta viva que propone este estudio, podría reproducirse o cultivarse para contar siempre con material de construcción, como si se tratara de la masa madre utilizada en panadería.

Por último, el equipo de investigación de Harvard sugiere combinar su desarrollo con otras tecnologías de materiales, «como las que ya están incorporando células vivas en materiales de construcción estructurales».